清世祖順治元年（公元1644年）
三月 明王朝滅亡，滿蒙八旗兵入關(guān)。十月，清王朝定都北京。
同年 鄂爾多斯部濟(jì)農(nóng)向清王朝朝貢，清王朝選鄂爾多斯騎兵隨英親王阿濟(jì)格赴陜西鎮(zhèn)壓李自成農(nóng)民軍。
清世祖顧治三年（公元1646年）
清王朝派盛京實(shí)勝寺喇嘛西布扎袞如克到庫(kù)倫（今庫(kù)倫旗），被授予盛京錫埒圖庫(kù)倫札薩克達(dá)喇嘛印，統(tǒng)領(lǐng)政教。至此，清代內(nèi)蒙古地區(qū)出現(xiàn)了一個(gè)政教合一的札薩克喇嘛旗——錫埒圖庫(kù)倫札薩克喇嘛旗（轄境相當(dāng)于今庫(kù)倫旗東部地區(qū)）。庫(kù)倫札薩克喇嘛旗曾一度隸屬于卓索圖盟。
□ 清王朝編成烏珠穆沁左旗，俗稱東烏珠穆沁旗（轄境相當(dāng)于今東烏珠穆沁旗東部和西烏珠穆沁旗東北部地區(qū)），同時(shí)編成浩齊特左旗（轄境相當(dāng)于今錫林浩特市東北部和東、西烏珠穆沁旗西部各一部分地區(qū)）。二旗均為札薩克旗。
□ 蘇尼特部騰機(jī)思在喀爾喀汗王的策動(dòng)下，舉兵反清。清王朝令豫親王多鐸率兵出擊，擊潰騰機(jī)思兵，繼而又擊敗往援的喀爾喀5萬(wàn)聯(lián)軍，騰機(jī)思北遁喀爾喀。
清世祖順治五年（公元1648年）
清王朝對(duì)蒙古盟旗王公貴族制定了朝覲制度，準(zhǔn)于其年節(jié)朝見。
□ 清王朝編成郭爾羅斯后旗（轄境相當(dāng)于今黑龍江省肇東、肇州、肇源三縣地區(qū)）、杜爾伯特旗（轄境相當(dāng)于今黑龍江省杜爾伯特蒙古族自治縣、大慶市、安達(dá)縣、林甸縣和泰來(lái)縣的一小部分地區(qū)）、扎賚特旗（轄境相當(dāng)于今扎賚特旗、吉林省大安縣、鎮(zhèn)賚以及黑龍江省泰來(lái)縣等旗縣的部分地區(qū)）。三旗均為札薩克旗。
□ 清王朝將扎魯特所部編為扎魯特左旗（轄境相當(dāng)于今霍林郭勒市、扎魯特旗東半部及開魯縣東北部地區(qū)）、扎魯特右旗（轄境相當(dāng)于今扎魯特旗西部及開魯縣西部大部分地區(qū)）；同時(shí)編巴林所部為巴林左旗和巴林右旗（二旗轄境相當(dāng)于今巴林左、右二旗和林西縣等地區(qū)）。四旗均為札薩克旗。
□ 清王朝將烏喇特所部編為烏喇特后旗、烏喇特中旗，烏喇特前旗，俗稱東公旗、中公旗、西公旗。三旗均為札薩克旗，同在一處游牧，沒有明顯界限（三旗轄境相當(dāng)于今烏拉特中、前、后三旗和五原，固陽(yáng)、臨河三縣（市）以及杭錦后旗各一部分地區(qū)）。
清世祖順治六年（公元1649年）
清王朝將鄂爾多斯所部編為鄂爾多斯左翼中旗，俗稱郡王旗（轄境相當(dāng)于今伊金霍洛旗和東勝市的大部、杭錦旗和達(dá)拉特旗一部，以及陜西省神木縣長(zhǎng)城以北地區(qū)）；鄂爾多斯左翼前旗，俗稱準(zhǔn)格爾旗（轄有今準(zhǔn)格爾旗等地區(qū)），鄂爾多斯右翼前旗，俗稱烏審旗（轄境相當(dāng)于今烏審旗的全部和陜西省榆林、橫山、靖邊三縣長(zhǎng)城以北地區(qū)及伊金霍洛旗一小部分地幟鮮明區(qū)）；鄂爾多斯右翼后旗，俗稱杭錦旗（轄境相當(dāng)于今杭錦旗北部、臨河縣大部、五原縣和杭錦后旗各一部分地區(qū)）。四開得勝旗均為札薩克旗。
□ 同年至清圣祖康熙六年（公元1667年），達(dá)斡爾各部相繼南遷嫩江流域，由清王朝編為都博淺、莫日登、訥莫爾3個(gè)扎蘭，由理藩院管轄。
□ 同年至清高宗乾隆元年（公元1736年），清王朝把所編鄂爾多斯左翼中旗、鄂爾多斯左翼前旗、鄂爾多斯左翼后旗、鄂爾多斯右翼前旗、鄂爾多斯右翼后旗、鄂爾多斯右翼中旗、鄂爾多斯右翼前末旗等七個(gè)札薩克旗，會(huì)盟于鄂爾多斯左翼中旗的伊克昭（今達(dá)拉特旗王愛召），稱為伊克昭盟（轄境相當(dāng)于今伊克昭盟全部地區(qū)、烏海市、臨河市、五原縣及杭錦后旗，烏拉特前旗的一部分、山西省偏關(guān)、河曲、寧夏回族自治區(qū)陶樂、鹽池等縣的部分地區(qū)、陜西省榆林、神木、橫山、靖邊、府谷等縣長(zhǎng)城以北地區(qū)）。
清世祖順治七年（公元1650年）
正月 沙皇俄國(guó)哈巴羅夫侵略軍入侵黑龍江地區(qū)，遭到索倫各部反擊和抵抗。
同年 清王朝編成科爾沁左翼后旗（轄境相當(dāng)于今科爾沁左翼后旗的大部分、通遼市的一部分、遼寧省昌圖縣的全部和康平縣的一部、吉林省雙遼縣的一小部分地區(qū)）?？茽柷咦笠砗笃鞛樵_克旗。
□ 清王朝編成鄂爾多斯左翼后旗，俗稱達(dá)拉特旗（轄境相當(dāng)于今達(dá)拉特旗壕慶河以西地區(qū)、東勝市的一部分，五原縣、臨河市、烏拉特前旗等部分地區(qū)及包頭市南部地區(qū)），鄂爾多斯右翼中旗（轄境相當(dāng)于今鄂托克旗和鄂托克前旗的全部、烏海市海勃灣區(qū)和海南區(qū)、陜西靖邊、定邊二縣和寧夏回族自治區(qū)鹽池縣長(zhǎng)城以北地區(qū)、陶樂縣黃河以東地區(qū)）。二旗均為札薩克旗。
清世祖順治八年（公元1651年）
清王朝編成阿巴噶左旗（轄境相當(dāng)于今阿巴嘎旗東北部和錫林浩特市西部地區(qū)）。阿巴噶左旗為札薩克旗。
清世祖順治九年（公元1652年）
清王朝將克什克騰部編為克什克騰旗（轄境相當(dāng)于今克什克騰旗全部和林西縣西部地區(qū)）?？耸部蓑v旗為札薩克旗。
清世祖頤治十年（公元1653年）
清王朝編成浩齊特右旗（轄境相當(dāng)于今錫林河下游地區(qū)）。浩齊特右旗為札薩克旗。
□ 清王朝編成喀爾喀右翼旗，亦稱達(dá)爾罕旗（轄境相當(dāng)于今達(dá)爾罕茂明安聯(lián)合旗東部和武川縣一部分地區(qū)）。喀爾喀右翼旗為札薩克旗。
清世祖順治十一年（公元1654年）
同年至清世祖順治十七年（公元1660年），達(dá)斡爾、鄂溫克、鄂倫春各族人民配合清軍在庫(kù)瑪爾河口、松花江口、古法壇等地，殲滅沙俄入侵者斯捷潘諾夫部。
清世祖順治十七年（公元1660年）
清王朝定八旗官職漢稱：固山額真稱都統(tǒng)，梅勒章京稱副都統(tǒng)，甲喇章京稱參領(lǐng)，牛錄章京稱佐領(lǐng)，昂邦章京稱總管。
□ 巴林右旗固倫淑慧公主聚資在西拉木倫河上興修“巴林橋”。
□ 同年前后，清王朝將黑龍江以北索倫各部（包括鄂溫克、鄂倫春、達(dá)斡爾等民族）南遷至今呼倫貝爾及黑龍江省西部一帶，歸黑龍江將軍（公元1683年設(shè)）統(tǒng)轄，又分歸逐步設(shè)立的齊齊哈爾、墨爾根副都統(tǒng)和呼倫貝爾、布特哈總管分別管轄。
清世祖順治十八年（公元1661年）
三月 清王朝對(duì)“外蕃世職”俱給俸祿，制定了世俸制度，分為九等。最高者年俸銀1 500兩、緞40匹；最低者為年俸銀100兩、緞4匹。由理藩院會(huì)同戶部發(fā)放。
清圣祖康熙元年（公元1662年）
鄂爾多斯部薩岡徹辰著《蒙古源流》成書。
□ 清圣祖康熙年間，歸化城大召前玉泉井旁，出現(xiàn)了一個(gè)懸壺行醫(yī)賣藥的小藥鋪——同泰永。這是由河北人在內(nèi)蒙古西部地區(qū)開辦的第一個(gè)中藥鋪。
清圣祖康熙三年（公元1664年）
清王朝將內(nèi)札薩克蒙古和外札薩克蒙古以戈壁為界，劃為內(nèi)蒙古與外蒙古。
□ 清王朝編成喀爾喀左旗（轄境相當(dāng)于今奈曼旗和庫(kù)倫旗的部分地區(qū)）。喀爾喀左旗為札薩克旗，屬昭烏達(dá)盟。
□ 清王朝編成茂明安旗（轄境相當(dāng)于今達(dá)爾罕茂明安聯(lián)合旗西部、包頭市白云鄂博礦區(qū)及固陽(yáng)縣的部分地區(qū)）。茂明安旗為札薩克旗，屬烏蘭察布盟。
清圣祖康熙四年（公元1665年）
清王朝編成阿巴哈納爾左旗（轄境初為今錫林浩特市北部，清末位置相當(dāng)于今錫林浩特市東部和東烏珠穆沁旗西部的一小部分地區(qū)）。阿巴哈納爾左旗為札薩克旗，屬錫林郭勒盟。
清圣祖康熙六年（公元1667年）
七月二十一日 清王朝決定將未編佐領(lǐng)的1 100名達(dá)斡爾人照例編為11個(gè)佐領(lǐng)，設(shè)置頭領(lǐng)管轄。
同年 清王朝編成阿巴哈納爾右旗（轄境相當(dāng)于今阿巴嘎旗東部的狹長(zhǎng)地帶）。阿巴哈納爾右旗為札薩克旗，屬錫林郭勒盟。
清圣祖康熙九年（公元1670年）
同年至清圣祖康熙二十年（公元1681年），清王朝修建新邊柳條邊（由壕、堤、柳組成的邊墻），自威遠(yuǎn)堡（今遼寧省開原縣東北），經(jīng)科爾沁左翼中旗、郭爾羅斯前，后二旗，到法得哈門與松花江相連，全長(zhǎng)690里。邊墻東南是滿洲人居地，西北為蒙古游牧地，是吉林與內(nèi)蒙古的分界線。
清圣祖康熙十年（公元1671年）
正月 蘇尼特二旗及四子部落旗因青草不生，又兼大雪，羊牛馬匹倒斃殆盡。清王朝動(dòng)用宜府、歸化城倉(cāng)糧賑濟(jì)。
清圣祖康熙十四年（公元1675年）
五月 察哈爾布爾尼親王反清失敗。清王朝廢其世襲爵位，將其部眾遷到大同、宣化邊外，按滿洲八旗建制，編為左、右兩翼。左翼四旗為鑲黃旗（旗地相當(dāng)于今鑲黃旗全部、化德縣、商都縣和河北省康保、尚義二縣的一部分地區(qū)）、正白旗（旗地相當(dāng)于今正鑲白旗西南部、太仆寺旗北部、河北省康保縣部分地區(qū)）、鑲白旗（旗地相當(dāng)于今正鑲白旗東北地區(qū)）、正藍(lán)旗（旗地相當(dāng)于今正藍(lán)旗北部地區(qū)）；右翼四旗為正黃旗（旗地相當(dāng)于今興和縣，察哈爾右翼前旗大部分及察哈爾右翼后旗東部和商都縣部分地區(qū)）、正紅旗（旗地相當(dāng)于今集寧市、察哈爾右翼前、后二旗西部、卓資縣東北部和奉鎮(zhèn)市西部地區(qū)）、鑲紅旗（旗地相當(dāng)于今察哈爾右翼中旗東南部、卓資縣東部、涼城縣大部、豐鎮(zhèn)市西部的一小部分地區(qū)），鑲藍(lán)旗（旗地相當(dāng)于今察哈爾右翼中旗西部及北部、卓資縣大部和涼城縣西部、武川縣一部地區(qū)），由在京蒙古都統(tǒng)兼轄。
同年 盤踞在雅克薩的沙俄軍300余人，在切爾尼柯夫斯基帶領(lǐng)下，竄至甘河地區(qū)（今呼倫貝爾盟境內(nèi)），妄圖裹脅當(dāng)?shù)氐倪_(dá)斡爾部落叛清投俄。達(dá)斡爾人趁其不備，連夜撤到嫩江流域。
清圣祖康熙十六年（公元1677年）
清王朝改阿敦（阿敦為滿語(yǔ)，意為馬群）衙門為上駟院，專管宮廷御用駝馬。其所屬的駝馬廠均由察哈爾上三旗牧放，稱作鑲黃、正黃、正白三旗官駝馬群廠。其中，察哈爾地區(qū)有兩處；一處上都河（今閃電河），另一處達(dá)布遜諾爾（今商都、化德，河北省張北和康保等縣交界地帶），合稱上都達(dá)布遜牧廠。
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