民國35年(1946)農歷正月,楊寶山托病回延安匯報工作,李富春鼓勵他繼續(xù)隱蔽。2月,又回到西官府。翌年,黨中央撤離延安,他失去與上級的直接聯(lián)系,但始終未暴露自己的身份。在等待黨中央機要局的指示期間,有時也與當?shù)刂泄步M織保持某些聯(lián)系,并協(xié)助做一些特定的工作,直到鄂托克旗解放為止。
1949年8月,鄂托克旗中華人民共和國成立后,他擔任鄂托克旗臨時人民政府三科科長、公安局長、人民政府委員、副旗長、旗委副書記等職。曾于1952年到北京參加國慶觀禮,多次受到黨中央領導人的宴請。1954年7月至1957年,離職到內蒙古干部文化學校學習。1960年7月,調任伊克昭盟(今鄂爾多斯市)盟委統(tǒng)戰(zhàn)部副部長兼盟政治學校校長。1965年初,任統(tǒng)戰(zhàn)部副部長兼盟宗教處處長。
中共十一屆三中全會后,楊寶山歷任伊克昭盟第三、四、五屆政協(xié)常委。1980年11月,被選為第六屆政協(xié)副主席。1994年3月12日,在伊克昭盟醫(yī)院逝世,享年79歲。